男性不育症的原因很多，分类方法也各异，这里以病变原发部位不同进行分类。
(1)内分泌疾病：①下丘脑-垂体病变。各种原因引起的低促性腺激素型性腺功能减退症(见284问)。②甲亢或甲低。③肾上腺皮质增生、肿瘤。
(2)睾丸疾病：指睾丸本身精子生成和成熟障碍。包括：①睾丸炎、外伤、放射线损伤及某些药物、毒物中毒。②染色体异常，仅有支持细胞综合征、两性畸形、隐睾。③精索静脉曲张。④特发性少精子症(成年人曲细精管功能衰竭)。
(3)精子输出管道受阻：①先天性输精管不通。②感染或创伤引起的输精管不通，如结核病、性病、各种炎症、疝修补损伤及误扎输精管等。
(4)精子不能进入女性生殖道：①阴茎损伤、阴茎过小、先天性畸形。②性功能障碍：阳痉、早泄、不射精或逆行射精等。
(5)性腺附属器官异常：有前列腺炎、附睾炎、精囊炎症等。
