激素在调节女性性功能中起重要作用。雌二醇水平影响整个外周和中枢神经系统中的神经传递。在动物模型中，给予雌二醇导致伴随阴部神经分布的接触受体区的扩大，提示雌激素影响感觉阈。对绝经的女性进行雌激素替代治疗可恢复阴蒂和阴道的震颤和降低感觉阈值恢复到绝经前的水平。雌激素还有血管保护和血管扩张的作用，导致阴道、阴蒂和尿道的动脉血流增加，阻止盆腔动脉和小动脉的动脉粥样硬化，使女性性反应得到保持。
随着年龄增长和绝经，循环中的雌激素水平下降，大多数女性性功能有不同程度的改变。这方面常见的主诉有性欲缺乏、性活动频率降低、性交疼痛、性反应性降低、达到性高潮困难及生殖器敏感性下降。Masters和』。hnson发现绝经期女性中与性功能有关的生理上的变化，他们报道与生殖道感觉和血流变化有关的症状部分继发于体内雌激素水平降低，和雌二醇水平低于50踞／m1有直接相关性。雌激素替代治疗可明显改善症状。
阴道一氧化氮合成酶，也受雌激素的调节。老龄和手术阉割导致阴道一氧化氮水平下降，阴道壁纤维化增加。雌激素替代治疗可保护阴道黏膜层，增加阴道一氧化氮水平，降低阴道黏膜细胞死亡。 •
因为孕激素有抗雌激素的活性，所以性刺激引起的性反应可能随着孕酮水平的提高而降低。经前期性行为的增加可能与此期孕酮水平降低有关。孕酮类药物可减少阴道分泌物、增加性交疼痛和降低性欲。孕激素在女性性活动中的确切作用机制还不清楚。
低睾酮水平也与性唤起、生殖器感觉、性冲动和性高潮的下降有关。有学者认为，雄激素在女性中的作用主要是在性动机而不是在性行为上。外源性雄激素可增加更年期前子宫和卵巢切除后的女性的性欲强度和性幻想频率。绝经前和绝经后女性给予100mg睾酮片剂治疗性压抑，效果良好。目前，FDA没有允许睾酮制剂用于女性，评价睾酮用于治疗女性性功能障碍潜在益处的临床研究正在进行。
